デフォルトだと、git add . してもdeleteされたファイルはコミット対象にならない。allオプションを付けるとコミット対象になる。 git add --all .

# masterブランチに切り替え git checkout master # masgerブランチにマージ git merge branch_name # 不要になったbranchを削除 git branch -d branch_name